أثرى الزحيلي المكتبة الإسلامية بـ 75 كتابًا، منها أربع موسوعات: الفقه الإسلامي وأدلته 11 مجلد، التفسير المنير 17 مجلد، أصول الفقه مجلدان، موسوعة الفقه الإسلامي المعاصر، 8 مجلدات، والمقدار الكامل للمطبوعات 120 مجلدا وخمسون ألف صفحة.
ومن كتبه، آثار الحرب في الفقه الإسلامي، مقارنة بين المذاهب الثمانية والقانون الدولي، تخريج وتحقيق أحاديث تحفة الفقهاء للسمرقندي، تخريج وتحقيق أحاديث وآثار (جامع العلوم والحكم لابن رجب الحنبلي) مع التعليق عليها، السلم والحرب في الإسلام، تم إصداره باللغة الفرنسية.
- الفقه الإسلامي وأدلته، 11 جزءًا، ترجم إلى التركية والماليزية والفارسية.
- الوجيز في الفقه الإسلامي.
- الوجيز في أصول الفقه، ترجم إلى التركية.
- أصول الفقه الإسلامي، ترجم إلى التركية.
- موسوعة الفقه الإسلامي المعاصر 8 مجلدات، دار المكتبي.
- موسوعة الفقه الإسلامي والقضايا المعاصرة 14 مجلدًا، دار الفكر.
- الأحكام الضرورية والقطعية في الإسلام.
- القرآن الكريم بنيته التشريعية، وخصائصه الحضارية، ترجم إلى التركية.
- الموسوعة القرآنية الميسرة.
- التفسير المنير في العقيدة والشريعة والمنهج، 16 جزءًا، حاصل على جائزة لأفضل كتاب في العالم الإسلامي للعام 1995.
- القرآن الكريم البنية التشريعية والخصائص الحضارية.
- التفسير الوجيز.
- التفسير الوسيط في ثلاثة مجلدات.
- الذرائع في السياسة الشرعية والفقه الإسلامي، رسالة ماجستير عام 1959م.
- قواعد الفقه الحنبلي من كتاب (المغني) لابن قدامة.
- تحقيق وتخريج أحاديث وآثار جامع العلوم والحكم لابن رجب.
تحقيق وتخريج واختصار كتاب (الأنوار في شمائل النبي المختار) للإمام محيي السنة البغوي.
- تحقيق وتقسيم وخدمة شاملة لكتاب (طريق الهجرتين وباب السعادتين) لابن قيم الجوزية.
- الاستنساخ جدل العلم والدين والأخلاق.
- تقديم وتحقيق نيل الأوطار للشوكاني.
- تقديم وتحقيق شرح مسلم للنووي.
- العلاقات الدولية في الإسلام.
- حقوق الإنسان في الإسلام، بالاشتراك مع آخرين.
- القانون الدولي الإنساني وحقوق الإنسان، ترجم إلى الماليزية.
- العالم الإسلامي في مواجهة التحديات الغربية، ترجم إلى التركية والماليزية.
- أصول الإيمان والإسلام.
- المجدد جمال الدين الأفغاني.
- الإسلام والإعاقة، بحث في رصد الظواهر الاجتماعية للمعوقين.
- مشكلات في طريق النهوض.
- العلاقات الدولية في الإسلام مقارنة بالقانون الدولي الحديث.
- حق الحرية في العالم.
- حوار حول تجديد الفقه الإسلامي.
- الأسرة المسلمة في العالم المعاصر.
- الإمام الشافعي.
- الموازنة بين القرآن والسنة في الأحكام.
- المصارف الإسلامية.
- المعاملات المالية المعاصرة.
- الاقتصاد الإسلامي، تم إصداره باللغة الإنجليزية.
- أخلاق المسلم علاقته بالمجتمع.
- أخلاق المسلم علاقته بالخالق.
- أخلاق المسلم بالنفس والكون.
شمائل المصطفى صلى الله عليه وسلم، ترجم إلى الماليزية، فتاوى العصر، فتاوى معاصرة، قواعد الأخلاق في القرآن الكريم، مجلدين، تحت الطبع، بيروت 2013
- العشرة المبشرون بالجنة، تحت الطبع.
- بيروت 2013.
- الوضوء والصلاة على المذهب المالكي, تحت الطبع دار الحافظ 2013.
- أحكام العبادات الناشئة، تحت الطبع دار الحافظ 2013.
- الأحاديث النبوية للناشئة، تحت الطبع دار الحافظ 2013.